RegEvol: detection of directional selection in regulatory sequences through phenotypic predictions and phenotype-to-fitness functions

El artículo presenta RegEvol, un marco innovador que combina predicciones de aprendizaje automático sobre la unión de factores de transcripción con modelos evolutivos explícitos para detectar selección direccional en secuencias reguladoras no codificantes, identificando así adaptaciones funcionales en regiones genómicas de *Drosophila* y humanos que antes eran difíciles de analizar.

Laverre, A., Latrille, T., Robinson-Rechavi, M.2026-03-05📄 evolutionary biology

Restricted amino acid diversity alters enzymatic phosphoryl-transfer catalysis

Este estudio demuestra que restringir la diversidad de aminoácidos en una enzima ancestral reconstruida remodela su sitio activo y reemplaza su función nativa por una reacción alternativa de transferencia de fosforilo que convierte ADP en ATP y AMP, ilustrando cómo las limitaciones químicas de la Tierra primitiva pudieron influir en la evolución catalítica temprana.

Yagi, S., Dasgupta, S., Tagami, S. + 1 more2026-03-05📄 evolutionary biology

A general evolutionary model for the emergence of novel characters from serial homologs

Este estudio propone un modelo evolutivo general que integra mecanismos selectivos, genéticos y de desarrollo para explicar cómo surgen novedades morfológicas a partir de la divergencia de homólogos seriales, utilizando simulaciones genéticas de poblaciones para demostrar cómo la selección y las restricciones del desarrollo interactúan para moldear la evolución de caracteres fenotípicos.

Jiang, D., Pennell, M., Sallan, L.2026-03-04📄 evolutionary biology

Constraints on the G1/S transition pathway may favor selection of multicellularity as a passenger phenotype

Este estudio demuestra que la multicelularidad simple en levaduras puede mantenerse como un rasgo pasajero seleccionado indirectamente porque el genotipo *ace2* acelera la salida de la quiescencia bajo ciertas condiciones del ciclo celular, independientemente de la ventaja directa del fenotipo multicelular en sí mismo.

Ducrocq, T. L., Laporte, D., DAIGNAN-FORNIER, B.2026-03-04📄 evolutionary biology

Cytoplasmic male sterility and mitochondrial metabolism: evidence for low complex I contribution in male-sterile freshwater snail Physa acuta

Este estudio demuestra que la esterilidad masculina citoplasmática en el caracol *Physa acuta* está asociada con una alteración en la respiración del complejo I mitocondrial en individuos estériles y con un mayor costo energético en los individuos restaurados, lo que sugiere un conflicto genético entre mitocondrias y núcleo que afecta el metabolismo aeróbico.

Bererd, S., Roussel, D., Plenet, S. + 3 more2026-03-03📄 evolutionary biology

SplitAligner: A Gene-Species Tree Reconciliation Framework Using Split-Based Branch Mapping

El artículo presenta SplitAligner, un marco de trabajo basado en divisiones (splits) que estandariza la comparación de ramas entre árboles de genes y especies al proyectar las ramas del árbol de especies en conjuntos de taxones variables, distinguiendo así entre la ausencia estructural por cobertura incompleta y la discordancia topológica para generar puntuaciones de concordancia y facilitar análisis evolutivos a nivel de rama.

Wu, J.2026-03-03📄 evolutionary biology

Organization and evolution of sex-biased gene expression in Drosophila adult sexual circuits

Mediante transcriptómica de célula única en circuitos sexuales de *Drosophila*, este estudio revela que la expresión génica sesgada por sexo es limitada, específica de tipo celular y evolutivamente dinámica, sugiriendo que la adaptación específica de cada sexo se logra mediante programas génicos selectivos en nodos de circuito localizados que preservan la evolvabilidad a pesar del acoplamiento transcriptómico general entre sexos.

Chen, D. S., Gifford, H., Kurmangaliyev, Y. Z. + 1 more2026-03-03📄 evolutionary biology

Direct and community-driven selection jointly drive body size evolution in harvested predator-prey systems

Este estudio demuestra que la evolución del tamaño corporal en sistemas depredador-presa sometidos a pesca está impulsada conjuntamente por la selección directa de la captura y los cambios indirectos en la estructura comunitaria, donde la evolución de las presas puede permitir la recuperación evolutiva de los depredadores, lo que subraya la necesidad de integrar la dinámica evolutiva en la gestión pesquera basada en ecosistemas.

Villain, T., Poggiale, J.-C., Duquenoy, B. + 1 more2026-03-03📄 evolutionary biology

Potential and limits of the evolutionary rescue of harvested food webs

Este estudio demuestra que, aunque la evolución inducida por la pesca puede aumentar la robustez general de las redes tróficas, su impacto es variable y depende de la tasa evolutiva y de la estrategia de pesca, revelando que concentrar la presión en niveles tróficos inferiores favorece la persistencia de la red, mientras que la pesca de depredadores puede generar un rescate evolutivo en niveles bajos a costa del colapso de niveles superiores.

Villain, T., Poggiale, J.-C., Peley, A. + 1 more2026-03-03📄 evolutionary biology

The distribution of fitness effects of new mutations in regulatory regions of the D. melanogaster genome

Este estudio utiliza simulaciones y datos de poblaciones africanas de *Drosophila melanogaster* para demostrar que, aunque las mutaciones en regiones reguladoras no codificantes son principalmente moderadamente deletéreas, estas regiones contribuyen a la mayor parte de las nuevas mutaciones deletéreas y sustituciones beneficiosas del genoma, lo que es fundamental para comprender con precisión la selección de fondo y la variación genómica.

Daigle, A., Marsh, J., Kay, A. + 1 more2026-03-03📄 evolutionary biology

Evolutionary Divergence of Structure-Function Coupling between Human and Macaque: Spatial Patterns and Transcriptomic Basis

Este estudio revela que el acoplamiento estructura-función difiere significativamente entre humanos y macacos, mostrando patrones espaciales distintos vinculados a la expansión cortical evolutiva y a perfiles transcriptómicos que destacan adaptaciones sinápticas y de neuroglía en humanos, lo que ofrece nuevas perspectivas sobre la base molecular de las capacidades cognitivas únicas de nuestra especie.

Ma, J., Li, W., Ma, Y. + 6 more2026-03-03📄 evolutionary biology